15 ноября 1917 г. созванный в Ташкенте III краевой съезд Советов принял декларацию о провозглашении Советской власти в крае и избрал Туркестанские ЦИК и Совет Народных Комиссаров.

В состав Совнаркома вошли большевики, левые эсеры и эсеры-максималисты. Председателем Совнаркома стал большевик Ф. И. Колосов.
Так же как и на других национальных окраинах России, в Туркестане против Советов выступили местные буржуазные националисты.
Буржуазно-националистическое мусульманское движение в Туркестане зародилось в паписламистских и лантюркистских кругах, группировавшихся вокруг организации «Шуро-и-Исламия» (Совет исламистов), образовавшейся па Ташкентском мусульманском съезде еще в марте 1917 г. Ее руководителями были прсдставители мусульманской интеллигенции, высшего духовенства, крупные торговцы и предприниматели.
После Октября в Ташкенте состоялся мусульманский съезд, который противопоставил себя Ш краевому съезду Советов. Съезд заянил, что «пути к самоопределению мусульман не могут быть иными, как только то, которые указаны в корапе и шариате», и потребовал предоставить в органах власти края половину мест здешней местной буржуазии и духовенству. В сущности, это было требование ликвидировать Сооетскую власть — власть рабочих и крестьян — и заменить ее властью местных баев и духовенства. III красной съезд Советов отверг притязания мусульманских реакционеров.
27 ноября лидеры буржуазных националистов шювъ созвали в Коканде (Ферганская область) общемусульманский съезд, который провозгласил «автономию» Туркестана и образовал «Сокет министров автономного Туркестана» во главе с лидером «Шуро-и-Исламия» Танышбаевым (вскоре его заменил Мустафа Чока-св). В городе Команде возникли две власти: в попом городе и крепости — Советская власть, то есть власть выборных от рабочих, солдат и местной бедпоты, в старом городе — власть «автономного правительства», то есть власть баев, богачей и мусульманского духовенства. «Кокандские автономисты» создали «вооруженные мусульманские силы», основу которых составил отряд басмачей под командованием известного в Фергане Иргаша, отбывавшего в прошлом наказание за разбой и ставшего при «автономистах начальником милиции в Коканде.