Президиум ВЦИК постановил детально ознакомиться с деятельностью ВЧК

и ее отделов и назначил с этой целью специальную комиссию. Одновременно для урегулирования деятельности центральной и местных чрезвычайных комиссий, а также их взаимоотношений с другими советскими учреждениями Президиум ВЦИК назначил комиссию по выработке «Положения о чрезвычайных комиссиях» под председательством Я. М. Свердлова. Вместе с тем Президиум указал «на необходимость продолжать беспощадную систему борьбы с контрреволюцией и контрреволюционерами» .
Принимая решительные меры против нарушения революционной законности, ЦК РКП(б) и Советское правительство боролись и с попытками некоторых обывательских элементов использовать начавшуюся дискуссию для дискредитации органов борьбы с контрреволюцией. В. И. Ленин решительно осудил обывательские нападки на чрезвычайные комиссии. В речи па митинге сотрудников ВЧК 7 ноября 1918 г. он говорил: «Когда мы взяли управление страной, нам, естественно, пришлось сделать много отпибок и естественно, что ошибки чрезвычайных комиссий больше всего бросаются в глаза.., У нас выхватывают отдельные ошибки Ч К, плачут и носятся с ними.
Мы ж о говорим: па ошибках мы учимся. Как во всех областях, так и в этой ыы говорим, что самокритикой мы научимся. Дело, конечно, не в составе работников Ч К, а в характере деятельности их, где требуется решительность, быстрота, а главное — иерность. Когда я гляжу на деятельность ЧК и сопоставляю ее с нападками, я говорю: это обывательские толки, ничего не стоящие».
А 19 декабри 4918 г. «ЦК партии постановил, что на страницах партийной п советской печати не может иметь место злостная критика советских учреждений, как это имело место в некоторых статьях о деятельности ВЧК, работы которой протекают в особо тяжелых условиях».