На основе этих ленинских мыслей комиссия Совета Обороны 3 декабря 1918 г. разработала предложения о работе ВЧК, которые вышли далеко за пределы обсуждавшегося вопроса о работе железнодорожных органов чрезвычайной комиссии по борьбе с контрреволюцией.
11 декабря 1918 г. Сонет Рабочей и Крестьянской Обороны принял постановление о порядку ареста сотрудников советских учреждений п предприятий. В нем указывалось, что аресты сотрудников болезненно отзываются на работе учреждений и предприятий, в то время как борьба с ополчившимся па Советскую Россию империализмом требует напряжения всех сил. Совет Обороны потребовал от НЧК и со местных органов в случаях, когда представится возможным, предварительно извещать соответствующее ведомство относительно своих постановлений об арестах ответственных работников, инженеров и техникой, занятых в промышленных предприятиях и па железных дорогах, а если невозможно известить предварительно, то делать зто не позднее 48 часов после ареста, сообщая вместе с тем и существо обвипенин. предъявленного арестованному. Народным комиссариатам, губернским и городским комитетам партии предоставлялось право посылать своих делегатов для участил в следствии об арестованных гражданах и право освобождать из-под ареста тех, за кого письменно поручатся два члена коллегии комиссариата или два члена городского или губернского комитета партии. Такое же право предоставлялось губернским и городским Советам депутатом (под письменное поручительство всех членов президиума), а также местным или центральным комитетам профсоюзов (под письменное поручительство всех членов правления союза) .
Это постановление усиливало контроль партийных органов за деятельностью комиссий, устанавливало право участия советских и профессиональных организаций в работе чрезвычайных комиссий, В нем нашла свое выражение и ленинская идея поручительства общественных организации при решении вопроса о судьбо арестованных. Тем самым постановление укрепляло начала социалистической законности в практике борьбы с контрреволюцией. В развитие этого постановления ВЧК издала 19 декабря приказ местным органам.
7 января 1919 г. Коллегия ВЧК решила сократить аппарат чрезвычайных комиссий и ликвидировать уездные ЧК. Это решение было подтверждено 24 января 1919 г. Президиумом
