26 июня ВЧК выступила с официальным разъяснением, в котором говорилось: «В большинстве газет Комиссия трактуется как следственная, и то время как Комиссия является Всероссийской Чрезвычайной комиссией по борьбе с контрреволюцией, саботажем и спекуляцией. Подобное «недоразумение» ведет к тому, что в значительной степени извращает задачи и цели работы Комиссии и представляет в совершенно ложном свете как функции, так и способы и образ действий Комиссии» только розыска и дознания, но и непосредственной расправы с наиболее опасными преступниками.

Усилили свою карательную функцию и революционные трибуналы. В. И. Ленин внимательно следил за разработкой положения о революционных трибуналах. Критикуя выработанный Наркоматом юстиции проект реорганизации трибуналов, В. И. Ленин 30 марта 1918 г. предлагал обратить главное внимание на то, чтобы сделать революционные трибуналы действительно революционными, скорыми и беспощадно строгими к контрреволюционерам, хулиганам, лодырям и дезорганизаторам судами3. Согласно этому указанию проект декрета о революциоппых трибуналах был переработан и принят на заседании Совета Народных Комиссаров 4 мая 1918 г. По декрету, в частности, при революционных трибуналах учреждались постоянные коллегии обвинителей, которые должны были участвовать в работе следственных комиссий, давать заключения о полноте расследования, формулировать обвинительные тезисы по расследованным делам и публично поддерживать обвинение в судебных заседаниях революционных трибуналов. Декрет определил также, что следстненные комиссии трибуналов должны разрешать все вопросы следствия в закрытых заседаниях. Это повышало роль обвинения, как стороны в судебном процессе.
Затем был образован революционный трибунал при ВЦИК. Согласно положению, принятому ВЦИК и СНК 29 мая 1918 г., его задачей было «суждение по долам, которые будут изъяты из подсудности местных революционных трибуналов». При этом трибунале учреждалась Центральная коллегия обвинителен, на которую помимо обычных обязанностей возлагалось ощо и «объединение и руководство деятельностью коллегии обвинителей местных рсзо-люцжншых трибуналов» . Докладчики Д. И. Курский и II. В. Крыленко на заседание ВЦИК отмечали, что эти меры принимаются ввиду необходимости усилить карательную политику против контрреволюционеров.